Kaj je toraj vloga ECS-ja? Z eno besedo, homeostaza. Homeostaza je obstoj stabilnega notranjega (celičnega) okolja v dinamičnem, vedno se spreminjajočem zunanjem okolju. Pristojnost tega sistema je ravnovesje in če je karkoli izven ravnovesja, bo ta sistem poskušal vzpostaviti prvotno stanje.
To se dogaja na celični ravni, če celica postane rakasta in se začne vesti nenormalno se bodo endokanabinoidi vezali na njo, kar sproži nepovratno kaskado reakcij, ki končno vodijo v programirano celično smrt (apoptozo) nenormalne celice.
Na področju tkiva, če obstaja poškodba, oteklina, bolečina in se začne pojavljati vnetje. Endokanabinoidi bodo imunskim celicam in žičnim celicam naročili, da ublažijo odziv na goreče bolečinske signale, zmanjšali bodo oteklino in onemogočili imunskim celicam, da bi izločale vnetne mulekule.
To sta samo dva primera vloge ECS-ja, vendar je bistvenega pomena, v skoraj vsakem pogledu našega kompleksnega življenskega motorja, koordinira interakcijo med našimi organi, živčni sistem, endokrini sistem in imunski sitem.